心內科是以心血管疾病診療為重點的綜合性臨床科室，全面開展高血壓，冠心病，心臟瓣膜病，先心病，急慢性心衰，心律失常等疾病為重點的診療工作。近年來，在院領導的支持下，購置了C型臂、心臟彩超、運動平板等大型設備，通過與蘭大一院等專家的協作，成功的開展了冠脈造影及支架植入，心臟起搏器的安裝等先進技術，使高血壓、冠心病、心絞痛、心肌梗塞、頑固性心衰、心律失常的診斷、治療水平得到了極大的提高，已成功施行了腎動脈造影、冠狀動脈造影及支架植入等手術，使冠心病、急性心肌梗塞、頑固性心衰、頑固性高血壓病，嚴重心律失常、缺血性心肌病等危重病的搶救成功率有了很大的提高，動態(tài)血壓、動態(tài)心電監(jiān)測、運動平板，心鈉素，肌鈣蛋白及心肌酶學等檢查、監(jiān)測，使冠心病、高血壓、心源性哮喘、肺水腫等心血管疾病的診治更加精確、規(guī)范，提高了危重病搶救成功率，減少了急慢性心肌梗塞、心力衰竭、致死性心律失常等嚴重并發(fā)癥的發(fā)生。
普外科臨床的全體員工同心同德，求真務實，特別是在院長何建宏的正確領導下，隨著新大樓的使用，使外科的規(guī)模明顯壯大，尤其在普外科，不僅床位由原來40多張擴大至60多張，亞專業(yè)有肝膽外科組、胃腸泌尿外科組、甲乳血管外科組、微創(chuàng)外科組等。
敦煌市醫(yī)院婦產科是敦煌及周邊地區(qū)集婦女保健，產前檢查，分娩，婦科疾患預防及治療的綜合科室，現有工作人員30名，其中副主任醫(yī)師3名，主治醫(yī)師3名，住院醫(yī)師3名，副主任護師1名，主管護師2名，助產士6名。
兒科是集醫(yī)、教、研為一體的小兒內科臨床科室，為酒泉地區(qū)重點?？疲涍^幾代兒科人的不懈努力，已發(fā)展成為一支朝氣蓬勃、奮發(fā)向上的專業(yè)團隊，擁有醫(yī)護人員三十余人，開放床位六十余張，分為普通兒科病區(qū)、重癥監(jiān)護病區(qū)、兒童保健康復門診及兒童門診治療中心。
