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哈佛學者揭示抑制癌細胞生長奧秘,助力開發(fā)出更好的癌癥療法
2023-11-14
來源:轉化醫(yī)學網(wǎng)
近日,美國哈佛醫(yī)學院Karen Adelman研究組發(fā)現(xiàn),當用藥物阻斷SWI/SNF時,第二種分子會挺身而出進行補償;在阻斷SWI/SNF的同時阻斷第二種分子可抑制實驗室培養(yǎng)皿中癌細胞的生長,這表明這種雙藥物組合療法可能對癌癥患者更有效。這一研究成果以“Global identification of SWI/SNF targets reveals compensation by EP400”為題,發(fā)表在國際學術期刊《Cell》上。
研究背景
哺乳動物SWI/SNF染色質重塑復合物在基因啟動子和增強子處移動和驅逐核小體,以調節(jié)DNA通路。盡管 SWI/SNF 亞基在疾病中很常見,但由于我們無法預測 SWI/SNF基因靶標和功能意義研究相互矛盾,治療選擇受到限制。
基因激活要求轉錄因子(TFs)和轉錄機制能夠在基因啟動子和順式調節(jié)增強子處訪問 DNA。DNA 可及性由染色質重塑劑產生,例如哺乳動物 SWI/SNF 復合物,它們利用來自 ATP 的能量滑動核小體或將其從 DNA 中驅逐出去。這些作用在啟動子和增強子處產生核小體耗盡區(qū) (NDR),促進 TF 結合和轉錄起始。此外,SWI/SNF 與使染色質更具活力有關,以幫助 RNA 聚合酶II (RNAPII) 克服基因體內的核小體屏障。因此,SWI/SNF的染色質重塑對于建立適當?shù)幕虮磉_模式至關重要。
抑制異常的基因活性
作者是通過解答 SWI/SNF 在健康細胞和癌細胞中的確切作用方式而獲得本論文這一發(fā)現(xiàn)的。Adelman說,“如果你確切了SWI/SNF復合物在正常細胞中的作用,你就能找到其他漏洞,從而知道如何更好地殺死癌細胞。了解基本機制確實有助于開發(fā)更好的治療策略?!?/span>
在人體細胞中,DNA被緊緊包裹成一種叫做染色質的形式,看起來就像一串微小的念珠。稱為染色質重塑劑的多種分子會在不同的位置解開染色質,暴露出某些基因,以便使用它們,然后重新包裝染色質,把基因重新藏起來。
SWI/SNF 就是這樣一種染色質重塑劑。人們已知道,它能在染色質上的念珠---核小體---周圍移動,讓核小體前后滑動,有時甚至將它們一并摘下,以控制基因的訪問。人們之前認為SWI/SNF療法通過阻止突變的SWI/SNF復合物為基因提供不適當?shù)脑L問途徑,就可抑制癌癥驅動基因的活性。
論文共同作者、Adelman實驗室生物化學與分子藥理學研究員Benjamin Martin和當時還是哈佛大學生物與生物醫(yī)學科學項目博士生的Eileen Ablondi發(fā)現(xiàn),事情并沒有那么簡單。阻斷SWI/SNF只能抑制一部分基因的活性。作者發(fā)現(xiàn),當他們抑制 SWI/SNF 時,起初所有基因都關閉了。他們進一步探究后發(fā)現(xiàn),另一種分子 EP400 會發(fā)揮作用,恢復基因訪問。只有同時阻斷 SWI/SNF 和 EP400,他們才能成功抑制異常的基因活性。
研究結果
在研究中,研究人員利用SWI/SNF重塑的速效抑制劑來闡明了SWI/SNF的直接靶點和作用。阻斷SWI/SNF活性會導致染色質可及性和轉錄的快速、全面喪失。雖然大多數(shù)增強子仍存在抑制作用,但研究人員發(fā)現(xiàn)了EP400/TIP60重塑因子的補償作用,它能在SWI/SNF長期缺失的情況下重建大多數(shù)啟動子的可及性。事實上,研究人員在癌細胞系和人類癌癥患者數(shù)據(jù)中觀察到了EP400和SWI/SNF之間的合成致死性。這些數(shù)據(jù)確定了一組分子基因組特征,它們能準確預測不同癌細胞系中基因對SWI/SNF抑制的敏感性,從而提高SWI/SNF抑制劑的治療潛力。
作者發(fā)現(xiàn),癌癥的類型似乎并不重要。這種雙管齊下的療法在代表四種癌癥---急性髓性白血病、彌漫性內生性橋腦膠質瘤(DIPG)、前列腺癌和非小細胞肺癌---的八種患者衍生性細胞系中起了作用。這些細胞系中有一些發(fā)生了 SWI/SNF 突變,有一些則沒有。
Adelman說,“這項新研究的部分優(yōu)勢在于,即使在SWI/SNF正常的癌細胞中也能使用這種雙管齊下的療法?!?/span>
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